Na ata da reunião de aprovação foram apontados “erros” e “incorrecções” no apuramento, designadamente a omissão de cerca de 120 mil eleitores e 60 mil votos no distrito de Setúbal e a contabilização a mais de 40 mil eleitores e 20 mil votos em Viseu.
No mesmo documento constam 4.431.849 votantes, menos 60.448 do que o inicialmente anunciado: 4.492.297.
Também o número de eleitores inscritos era diferente, 9.543.550 contra os 9.656.797 anunciados no portal www.presidenciais.mj.pt na noite eleitoral.
Na sequência das discrepâncias, o PCP requereu a presença da CNE e do director-geral da Administração Eleitoral, Jorge Miguéis, na Comissão de Assuntos Constitucionais, Direitos, Liberdades e Garantias, o que acabou por ser aprovado por todos os grupos parlamentares.