Voluntários de todo o país estão a contribuir para o primeiro Atlas dos Morcegos de Portugal, um trabalho coordenado pelo Instituto da Conservação da Natureza e da Biodiversidade (ICNB) que visa mapear e sensibilizar para estas espécies.
O Atlas dos Morcegos de Portugal está a ser elaborado no âmbito do Ano do Morcego, que se celebra entre 2011 e 2012.
Actualmente, pouco é ainda conhecido sobre a distribuição de algumas das espécies no território nacional, que encontram muitas ameaças como a destruição da floresta, a colisão com aerogeradores ou a utilização de grutas como depósitos de lixo.